Aplikacija Merlin Bird ID usko je povezana s projektom eBird, globalnom bazom ornitoloških opažanja kojom također upravlja Cornell Lab of Ornithology. eBird djeluje od 2002. godine kao suradnička i javno dostupna platforma za prikupljanje podataka o pojavljivanju i ponašanju ptica. Svaki registrirani korisnik stručnjak ili amater može zabilježiti svoja opažanja ptica, uključujući fotografije, audiozapise i lokacije.
Ova golema zbirka podataka (koja će 2025. sadržavati milijarde zapisa) ključna je osnova za pravilno funkcioniranje Merlina. Zahvaljujući eBirdu, aplikacija ima ažurirane informacije o tome:

eBird platform.